法定办结时限是10个工作日，承诺办结时限是5个工作日。①申请。申请人通过全国排污许可管理信息平台向核发生态环境部门（市级生态环境局）提交申请材料，并同时提交通过平台印制的书面申请材料。②受理。核发生态环境部门收到申请材料后，对申请材料的完整性、规范性进行审查。核发生态环境部门在全国排污许可证管理信息平台上作出受理或者不予受理排污许可证申请的决定，同时向排污单位出具加盖本行政机关专用印章和注明日期的受理单或者不予受理告知单。③审查。申请材料受理后，核发生态环境部门组织相关部门进行审查或委托技术机构开展技术审查。对于申请材料中存在疑问的，可开展现场核查。④决定。对于符合要求、作出准予许可决定的，向全国排污许可管理信息平台提交审核结果材料，重新发放排污许可证。对于不符合许可要求的，制作不予许可决定书，书面告知排污单位不予许可的理由，并向申请人反馈。